La Vicerrectoría de Gestión Universitaria (VGU) orienta las políticas institucionales encaminadas a la gestión y desarrollo de procesos de investigación, extensión y proyección social, difusión del conocimiento y articulación de los egresados con las dinámicas institucionales. Desarrolla sus actividades en el marco de cinco dependencias que establecen relaciones y acciones conjuntas con las facultades, los departamentos y programas académicos.

En la VGU se articulan acciones de cinco unidades administrativas de apoyo directo a la misión: La Subdirección de Gestión de Proyectos (CIUP), la Subdirección de Asesorías y Extensión (SAE), el Grupo Interno de Trabajo Editorial (GITE), el Centro de Lenguas (CLE) y el Centro de Egresados. Las actividades que realizan estas unidades las definen cuerpos colegiados presididos por la VGU, que trazan los lineamientos para la acción, la toma de decisiones y la prospectiva de sus procesos y estrategias. Estos cuerpos colegiados son el Comité de Propiedad Intelectual y Publicaciones, el Comité de Investigaciones y Proyección Social y el Comité de ética en la Investigación.